Česká verze English version Homepage Kontakty Databáze býků webKUMP Junior team MilujuHovězí.cz Facebook

Hlavní nabídka
Novinky
Dotace (421)
Legislativa (164)
Šlechtění (164)
Výběry býků (237)
Výstavy (215)
Zdraví (198)
Pozvánky (325)
Zajímavosti (181)
Ze svazu (334)
všechny novinky
ČSCHMS
Zápisy
Odchovny PB
Legislativa
Šlechtění a PK
Dotace, programy
Akce, výstavy
Kontakty
Odkazy
Hovězí maso
Burza zvířat
Databáze býků
webKUMP

Plemena
Aberdeen angus
Belgické modré
Blonde d'Aquitaine
Galloway
Gasconne
Hereford
Highland
Charolais
Limousine
Masný simentál
Piemontese
Salers
Aubrac
Parthenaise
Shorthorn
Texas longhorn
Bazadaise
Wagyu
Vosgienne
Rouge des Prés
Andorrské hnědé
Dexter
Pinzgauer

Požadavky na genotyp SNP ze zahraničí

04.06.2018,  Kamil Malát  

Ověřování původu prostřednictvím genotypování skotu pomocí analýzy SNP (Single Nucleotide Polymorphism) se stává postupně ve většině zemí běžnou praxí. Dříve či později nahradí dosud běžné testování přes mikrosatelity (STR) a bude jedinou oficiálně uznávanou metodou. V případě, že se chystáte dovést plemenné zvíře ze zemí, kde je tento způsob ověřování původu již rutinou (například Francie), je třeba mít na paměti, že pokud nechcete dělat analýzu v ČR znovu, je nutné si od prodávajícího dopředu vyžádat kompletní dokumentaci a to v elektronickém formátu.

Vzhledem k tomu, že dosavadní praxe ukazuje, že chovatel při nákupu plemenných zvířat získá zpravidla jen část informací (obvykle šestistránkový soubor pdf - viz tento a tento vzor), které jsou pro ověření původu nedostatečné nebo v nevyhovujícím formátu (vytištěné, přeskenované jako obrázek atd.), nadefinovala laboratoř imunogenetiky Českomoravské společnosti chovatelů a.s. minimální požadavky na genotyp dodaný z jiné laboratoře:

  • Minimálně sada paternitních SNP dle panelu ISAG (celkem 199 SNP) – vzor viz tento odkaz (csv soubor)
    Pozn.: v 1. sloupci je ušní číslo zvířete, ve 2. názvy paternitních SNP, ve 3. a 4. hodnoty jednotlivých SNP (hodnoty Allele1-Top a Allele 2-Top)
  • elektronický formát - ideálně csv nebo txt formát, tak jak je vytvářen coby výstup z Genome Studia – vzor viz tento odkaz (txt soubor)
    Pozn.: v 1. sloupci je název SNP, ve 2. ušní číslo zvířete, ve 3. názvy paternitních SNP, ve 3. a 4. hodnoty SNP ve formátu pro výpočet plemenné hodnoty, v 5. a 6. hodnoty SNP ve formátu pro ověření původu (hodnoty Allele1-Top a Allele 2-Top) a v 7. GS score (ukazatel kvality odečtu jednotlivých SNP)

Znovu opakujeme, že v případě nedodání těchto dokumentů je nutné provést ověření původu v České republice znovu! Praxe ukázala, že většina evropských laboratoří s předáním kompletních výsledků v elektronické podobě nemá problém, jednou z mála, která nekomunikuje a na žádosti nereaguje, je francouzská Labogena.

*******************************************************************************

Ceník SNP testů laboratoře imunogenetiky ČMSCH a.s. na rok 2018:

• Cena za samotný test na čipu (+ zaslání souboru k výpočtu plemenných hodnot, pokud bude zákazník vyžadovat): 1.050 Kč
• Cena za porovnání původu a vystavení protokolu o původu: 200 Kč
• Cena za vystavení protokolu o výsledu testování vybraných QTL a dědičných defektů: 100 Kč
• Cena za ruční zapsání objednávky do databáze: 20 Kč
• Příplatek za izolaci nestandardně odebraných vzorků: 120 Kč
(ušní štěpy, nekvalitně odebrané chlupy apod. – vzorky které nelze zpracovat v hromadném režimu chodu laboratoře a pomocí automatizace)
• Cena za vyextrahování kompletního SNP profilu zvířete chovateli (v el. formě): 200 Kč
(jedná se o vyextrahování jednoho konkrétního zvířete např. pro potřeby jeho exportu atd.)
Informace obsažené na webu cschms.cz nesmí být zvěřejněny bez souhlasu autorů. Prohlížením webu souhlasíte s právními podmínkami
Obsah webu: © 1991, 2006 Český svaz chovatelů masného skotu   Design & application: © 1999, 2006 WebApplications.cz