Ověřování původu prostřednictvím genotypování skotu pomocí analýzy SNP (Single Nucleotide Polymorphism) se stává postupně ve většině zemí běžnou praxí. Dříve či později nahradí dosud běžné testování přes mikrosatelity (STR) a bude jedinou oficiálně uznávanou metodou. V případě, že se chystáte dovést plemenné zvíře ze zemí, kde je tento způsob ověřování původu již rutinou (například Francie), je třeba mít na paměti, že pokud nechcete dělat analýzu v ČR znovu, je nutné si od prodávajícího dopředu vyžádat kompletní dokumentaci a to v elektronickém formátu.

Vzhledem k tomu, že dosavadní praxe ukazuje, že chovatel při nákupu plemenných zvířat získá zpravidla jen část informací (obvykle šestistránkový soubor pdf - viz tento a tento vzor), které jsou pro ověření původu nedostatečné nebo v nevyhovujícím formátu (vytištěné, přeskenované jako obrázek atd.), nadefinovala laboratoř imunogenetiky Českomoravské společnosti chovatelů a.s. minimální požadavky na genotyp dodaný z jiné laboratoře:

• Minimálně sada paternitních SNP dle panelu ISAG (celkem 199 SNP) – vzor viz tento odkaz (csv soubor)
  Pozn.: v 1. sloupci je ušní číslo zvířete, ve 2. názvy paternitních SNP, ve 3. a 4. hodnoty jednotlivých SNP (hodnoty Allele1-Top a Allele 2-Top)
  
• elektronický formát - ideálně csv nebo txt formát, tak jak je vytvářen coby výstup z Genome Studia – vzor viz tento odkaz (txt soubor)
  Pozn.: v 1. sloupci je název SNP, ve 2. ušní číslo zvířete, ve 3. názvy paternitních SNP, ve 3. a 4. hodnoty SNP ve formátu pro výpočet plemenné hodnoty, v 5. a 6. hodnoty SNP ve formátu pro ověření původu (hodnoty Allele1-Top a Allele 2-Top) a v 7. GS score (ukazatel kvality odečtu jednotlivých SNP)

Znovu opakujeme, že v případě nedodání těchto dokumentů je nutné provést ověření původu v České republice znovu! Praxe ukázala, že většina evropských laboratoří s předáním kompletních výsledků v elektronické podobě nemá problém, jednou z mála, která nekomunikuje a na žádosti nereaguje, je francouzská Labogena.

*******************************************************************************

Ceník SNP testů laboratoře imunogenetiky ČMSCH a.s. na rok 2018:

• Cena za samotný test na čipu (+ zaslání souboru k výpočtu plemenných hodnot, pokud bude zákazník vyžadovat): 1.050 Kč
• Cena za porovnání původu a vystavení protokolu o původu: 200 Kč
• Cena za vystavení protokolu o výsledu testování vybraných QTL a dědičných defektů: 100 Kč
• Cena za ruční zapsání objednávky do databáze: 20 Kč
• Příplatek za izolaci nestandardně odebraných vzorků: 95 Kč
(ušní štěpy, nekvalitně odebrané chlupy apod. – vzorky které nelze zpracovat v hromadném režimu chodu laboratoře a pomocí automatizace)
• Cena za vyextrahování kompletního SNP profilu zvířete chovateli (v el. formě): 200 Kč
(jedná se o vyextrahování jednoho konkrétního zvířete např. pro potřeby jeho exportu atd.)