Aktuální situace v projektu Interbeef
21.06.2013, Pavel Bucek, ČMSCH a.s. |
Na konci května se uskutečnil kongres ICAR v Dánském Aarhusu. Součástí bylo i jednání technické komise Interbeef a pracovní skupiny Interbeef - skupiny pro mezinárodního hodnocení masných plemen skotu, kterého je členem i Česká republika. Tento příspěvek uvádí ve stručnosti hlavní výsledky tohoto jednání a nastiňuje další vývoj v tomto projektu.
V současné době je nejproblematičtější oblast pravidel pro publikování výsledků. Toto jednání není v současné době uzavřeno a bude pokračovat na konci srpna ve Francii. Jedná se o problematický bod, protože jednotlivé země mají odlišné zájmy a rozdílnou úroveň v jednotlivých ukazatelích pro publikování (například vysoké hodnoty reliability pro publikování ve Francii a nižší v ostatních zemích). Před jednáním ve Francii je plánován Test Run a každá země bude mít k dispozici data a možnost na základě analýz obhájit svou pozici v této velice důležité oblasti.
Ukazatele a hlavní principy diskutované v současné době:
• reliability;
• počet potomků;
• publikace přinejmenším v jedné (minimální počet zemí) zemi, počet potomků v jedné nebo více zemích;
• podmínky pro publikování na národní a mezinárodní úrovni;
• zvířata z dané členské země;
• označení zvířat v Interbull pro publikování;
• jednoduchá pravidla pro publikování a další kritéria.
Přepočtené odstavové hmotnosti
Druhé zpracování mezinárodní genetické evaluace pro odstavové hmotnosti bylo provedeno v březnu 2013. Z výsledků vyplynulo, že statistický software využitý pro zpracování je na uspokojivé úrovni. Stále však existují otevřené otázky k řešení jedná se o diskusi o korelacích mezi jednotlivými zeměmi, odhadech parametrů, řešení nekonzistence v některých intervalech u ukazatele reliability a další. Po skončení každého zpracování budou k dispozici podrobné výsledky z Interbull. Rutinní výpočet pak bude v září 2013. Pravděpodobně nebude ještě publikován. Byl vykázán značný pokrok a z jednání je patrný optimismus do budoucnosti.
Výzkum ukazatelů obtížnosti porodů
Dalším bodem jednání byla diskuse o situaci výzkumného týmu z ČMSCH, a. s., Výzkumného ústavu živočišné výroby a Českého svazu chovatelů masného skotu v oblasti vývoje modelu pro obtížnost porodů. Byla podepsána dohoda o výzkumu mezi ICAR a ČMSCH, a. s., zaslána data do ČR z Interbull od jednotlivých zemí. Došlo k vyjasnění některých sporných bodů a požadavek na doplnění některých informací z některých zemí, které poskytly data. Na kongresu ICAR v Dánsku na jednání technické komise byly prezentovány první výsledky tohoto výzkumu s pozitivní odezvou z jednotlivých členských zemí Interbeef. Dalšími milníky bude prezentace dílčích výsledků ve Francii (Nantes) a na jednání Interbeef, které bude v ČR.
Výzkum možností využití dat od kříženců
Za tuto oblast je zodpovědné Irsko. Tento výzkum bude zaměřen na vývoj procedur pro zajištění přesného odhadu heteroze a rekombinace. Irsko (ICBF) spolupracuje úzce s Interbull na tomto výzkumném úkolu.
Výzkum – mezinárodní genetická evaluace pro zpeněžování na jatkách
Tento výzkum bude zajištěn výzkumným týmem z Velká Británie ve spolupráci s Irskem. Byla vytvořena Post Doc pozice, pro kterou bylo zajištěno financování. Podrobný návrh bude představen v průběhu příštího jednání Interbeef. Důležité je, že pro tento výzkum budou potřeba data od kříženců a znalosti postupů, jak jsou evidováni v jednotlivých členských zemích Interbeef (data jsou často z komerčních stád, která praktikují křížení).
Poplatky
Základem pro výpočet členských poplatků pro Interbeef je model využívaný pro mezinárodní genetickou evaluaci pro dojená plemena (Interbull).
Poplatky pro Interbeef budou mít tuto strukturu:
• základní poplatek, který bude pokrývat náklady spojené s Interbull (zajišťuje zpracování dat, rutinní výpočty, administrativní podporu a technickou podporu uživatelům - členským zemím Interbeef);
• dodatečný (doplňkový) poplatek pro nové vlastnosti a znaky, bude respektovat dodatečné náklady v Interbull, budou kalkulovány jako % z celkových základních poplatků;
• tyto dodatečné náklady jsou relativně nízké, do tohoto modelu poplatků nebudou zahrnuta „plemena“;
• úprava poplatků na skutečné náklady v Interbull v závislosti na počtu servisních uživatelů, kteří se projektu účastní.
Časový plán:
• Srpen - test run a diskuse o pravidlech pro publikaci výsledků;
• příští rutinní evaluace v září 2013 (uzávěrka 17. září 2013);
• výsledky 31. září;
• validace pro nové a staré členské organizace;
• oprava zvířat pro zpracování dokončena do 17. září.
Nové země zapojené do projektu Interbeef:
• Švýcarsko – podepsalo dohodu;
• Německo – před podepsáním dohody, jednání stále probíhají;
• Jihoafrická Republika – jednání stále probíhá.
Klíčové okruhy pro Interbeef:
• vyřešení odhadu parametrů, reliability a některé otázky týkající se modelu pro přepočtené odstavové hmotnosti;
• září 2013 - oficiální genetická evaluace pro hmotnosti;
• integrace nových servisních uživatelů;
• odhad parametrů červenec 2013;
• zvýšení počtu servisních uživatelů;
• ukončení výzkumu v ICBF (Irsku) a ČR;
• začátek výzkumu pro zpeněžování na jatkách.
Příští jednání:
• Francie (Nantes) – 27. srpna (Technická komise);
• Working Group meeting v Praze 21. listopadu 2013;
• Berlín květen 2014.
V současné době je nejproblematičtější oblast pravidel pro publikování výsledků. Toto jednání není v současné době uzavřeno a bude pokračovat na konci srpna ve Francii. Jedná se o problematický bod, protože jednotlivé země mají odlišné zájmy a rozdílnou úroveň v jednotlivých ukazatelích pro publikování (například vysoké hodnoty reliability pro publikování ve Francii a nižší v ostatních zemích). Před jednáním ve Francii je plánován Test Run a každá země bude mít k dispozici data a možnost na základě analýz obhájit svou pozici v této velice důležité oblasti.
Ukazatele a hlavní principy diskutované v současné době:
• reliability;
• počet potomků;
• publikace přinejmenším v jedné (minimální počet zemí) zemi, počet potomků v jedné nebo více zemích;
• podmínky pro publikování na národní a mezinárodní úrovni;
• zvířata z dané členské země;
• označení zvířat v Interbull pro publikování;
• jednoduchá pravidla pro publikování a další kritéria.
Přepočtené odstavové hmotnosti
Druhé zpracování mezinárodní genetické evaluace pro odstavové hmotnosti bylo provedeno v březnu 2013. Z výsledků vyplynulo, že statistický software využitý pro zpracování je na uspokojivé úrovni. Stále však existují otevřené otázky k řešení jedná se o diskusi o korelacích mezi jednotlivými zeměmi, odhadech parametrů, řešení nekonzistence v některých intervalech u ukazatele reliability a další. Po skončení každého zpracování budou k dispozici podrobné výsledky z Interbull. Rutinní výpočet pak bude v září 2013. Pravděpodobně nebude ještě publikován. Byl vykázán značný pokrok a z jednání je patrný optimismus do budoucnosti.
Výzkum ukazatelů obtížnosti porodů
Dalším bodem jednání byla diskuse o situaci výzkumného týmu z ČMSCH, a. s., Výzkumného ústavu živočišné výroby a Českého svazu chovatelů masného skotu v oblasti vývoje modelu pro obtížnost porodů. Byla podepsána dohoda o výzkumu mezi ICAR a ČMSCH, a. s., zaslána data do ČR z Interbull od jednotlivých zemí. Došlo k vyjasnění některých sporných bodů a požadavek na doplnění některých informací z některých zemí, které poskytly data. Na kongresu ICAR v Dánsku na jednání technické komise byly prezentovány první výsledky tohoto výzkumu s pozitivní odezvou z jednotlivých členských zemí Interbeef. Dalšími milníky bude prezentace dílčích výsledků ve Francii (Nantes) a na jednání Interbeef, které bude v ČR.
Výzkum možností využití dat od kříženců
Za tuto oblast je zodpovědné Irsko. Tento výzkum bude zaměřen na vývoj procedur pro zajištění přesného odhadu heteroze a rekombinace. Irsko (ICBF) spolupracuje úzce s Interbull na tomto výzkumném úkolu.
Výzkum – mezinárodní genetická evaluace pro zpeněžování na jatkách
Tento výzkum bude zajištěn výzkumným týmem z Velká Británie ve spolupráci s Irskem. Byla vytvořena Post Doc pozice, pro kterou bylo zajištěno financování. Podrobný návrh bude představen v průběhu příštího jednání Interbeef. Důležité je, že pro tento výzkum budou potřeba data od kříženců a znalosti postupů, jak jsou evidováni v jednotlivých členských zemích Interbeef (data jsou často z komerčních stád, která praktikují křížení).
Poplatky
Základem pro výpočet členských poplatků pro Interbeef je model využívaný pro mezinárodní genetickou evaluaci pro dojená plemena (Interbull).
Poplatky pro Interbeef budou mít tuto strukturu:
• základní poplatek, který bude pokrývat náklady spojené s Interbull (zajišťuje zpracování dat, rutinní výpočty, administrativní podporu a technickou podporu uživatelům - členským zemím Interbeef);
• dodatečný (doplňkový) poplatek pro nové vlastnosti a znaky, bude respektovat dodatečné náklady v Interbull, budou kalkulovány jako % z celkových základních poplatků;
• tyto dodatečné náklady jsou relativně nízké, do tohoto modelu poplatků nebudou zahrnuta „plemena“;
• úprava poplatků na skutečné náklady v Interbull v závislosti na počtu servisních uživatelů, kteří se projektu účastní.
Časový plán:
• Srpen - test run a diskuse o pravidlech pro publikaci výsledků;
• příští rutinní evaluace v září 2013 (uzávěrka 17. září 2013);
• výsledky 31. září;
• validace pro nové a staré členské organizace;
• oprava zvířat pro zpracování dokončena do 17. září.
Nové země zapojené do projektu Interbeef:
• Švýcarsko – podepsalo dohodu;
• Německo – před podepsáním dohody, jednání stále probíhají;
• Jihoafrická Republika – jednání stále probíhá.
Klíčové okruhy pro Interbeef:
• vyřešení odhadu parametrů, reliability a některé otázky týkající se modelu pro přepočtené odstavové hmotnosti;
• září 2013 - oficiální genetická evaluace pro hmotnosti;
• integrace nových servisních uživatelů;
• odhad parametrů červenec 2013;
• zvýšení počtu servisních uživatelů;
• ukončení výzkumu v ICBF (Irsku) a ČR;
• začátek výzkumu pro zpeněžování na jatkách.
Příští jednání:
• Francie (Nantes) – 27. srpna (Technická komise);
• Working Group meeting v Praze 21. listopadu 2013;
• Berlín květen 2014.