Od 1. října 2018 plánuje laboratoř imunogenetiky ČMSCH a.s. plný přechod výhradně na nový způsob ověřování původu prostřednictvím genotypování skotu pomocí analýzy SNP (detailněji zde). Mění se nejenom metoda, ale i forma příjmu objednávek. Nově byla pro tyto účely zřízena webová aplikace igenetika.cz, kam se budou požadavky na analýzy nejenom zadávat, ale kde současně budete moci sledovat i stav jejich vyřizování. Sloužit bude zároveň jako archiv všech vašich objednávek. ČMSCH a.s. také nabízí nové odběrové sety k odeslání odebraných vzorků chlupových cibulek do laboratoře imunogenetiky k izolaci DNA skotu (více zde). Registrovat a přihlašovat na portál igenetika.cz se můžete již nyní pod odkazem níže.

Registrovat na portál igenetika.cz se můžete tomto online odkazu.

Stručný výčet nejpodstatnějších změn pro chovatele:

1. přechod na ověřování pomocí SNP klade výrazně vyšší nároky na kvalitu odebíraného genetického materiálu (vzorku pro testaci). Z tohoto důvodu je nutná jistá míra standardizace odběru zdroje DNA. Vzhledem k tomu, že nemalá část našich chovatelů má stále problém s odběrem kvalitního vzorku i pro "obyčejné" ověření původů přes mikrosatelity, je nutné znovu upozornit na článek, který jsme ke správnému odebírání vzorku pro testaci DNA opakovaně publikovali (článek a instruktážní video zde). Pro industriální způsob izolace kvalitní DNA, kterou technologie SNP nárokuje a samotná možnost provedení SNP analýzy je kvalitou DNA podmíněna a limitovaná, se jako vhodné zdroj DNA jeví náležitě provedený odběr chlupových cibulek případně nasální stěr (viz náš článek zde). Pro zajištění rutinně zpracovávaného vysokého počtu izolací z chlupů bude během února připraven odběrový kit. Jako alternativní zdroj DNA nadále zůstává nesrážlivá krev a sperma.

Odběr chlupů pro analýzu DNA s novým odběrovým setem:

Pro chovatele, kteří ve větší míře realizují embryotransfer je podstatné rovněž to, že z důvodu eliminace chimérismu bude u zvířat po ET a vícečetných porodech jako jediný biologický vzorek připuštěn pouze ve formě chlupových cibulek (při použití ektodermálních tkání nebyl chimérismus ve vzorcích DNA pozorován, což u nasálního stěru a zejména pak krve rozhodně neplatí).

2. Zavedení SNP technologie nebude přinášet urychlení procesu ověření původu, spíše naopak. SNP metodické postupy jsou časově náročnější. Je proto nutné počítat s tím, že laboratoř imunogenetiky nebude schopna provést ověření za kratší dobu než 7 dní. Při větších sériích vzorků bude dodací lhůta ještě delší. Buďte proto na to připravení a zasílejte vzorky k analýze s dostatečným předstihem! ČMSCH a. s. aktuálně vyvíjí systém, který umožní online sledování stavu zpracování vaší objednávky. Ten by měl být spuštěn nejpozději spolu s novou technologií.

3. Izolace DNA a ověření původu přes SNP bude o něco dražší v porovnání s cenou jakou platí chovatelé nyní. Podle předběžných kalkulací ČMSCH a. s. bude cena zřejmě následující:

• vlastní genotypování skotu: 1050 Kč
• ověření původu zvířete (protokol): 200 Kč
• příplatek za manuální zpracování objednávky: 20 Kč
(ruční pořízení objednávky do elektronického systému)

Po tomto výčtu by se mohlo na první pohled zdát, že přechod na novou technologii SNP má pro chovatele spíše negativa, ale opak je pravdou. Pokrok nelze zastavit a to platí i v technologiích pro chov skotu a navazujících oborech kam spadá i ověřování původu skotu. Jednak je třeba se dívat do budoucna a vnímat to, že nemůžeme zůstat osamoceným ostrůvkem uprostřed progresivních "dravců", ale i my - chceme-li být i nadále úspěšnou exportní zemí - musíme tyto trendy následovat. Zároveň lze předpokládat, že s masivnějším využíváním genotypizace půjdou ceny této technologie dolů (zejména čipů na kterých se testace provádí). V neposlední řadě je na analýzu DNA státní dotace (titul 2.A.a. - do 500 Kč za provedenou analýzu u skotu a prasat resp. do 70 % nákladů na analýzu vykonávanou třetí stranou nebo jejich jménem s cílem stanovení genomické plemenné hodnoty), která by měla pokračovat i do budoucna a měla by zajistit, že konečné náklady na testaci budou pro chovatele na podobné výši jako doposud.

Pro ty, kteří by se chtěli o SNP technologii dozvědět více, připomínám, že tomuto tématu jsme se detailně věnovali v našem zpravodaji ve dvou článcích Ing. Daniely Schröffelové, CSc. z Českomoravské společnosti chovatelů a. s.. Velmi čtivě psané příspěvky s názvem "Změny v metodice ověřování původu skotu DNA technologií ...aneb je tu znova doba nová – přechodová!" (zpravodaj 4/2016, str. 41 - 43) a "Změny v metodice ověřování původu skotu DNA technologií ...aneb Genomika tak trochu sluha – tak trochu pán!" (zpravodaj 2/2015, str. 17- 19) lze nalézt i v archivu starších čísel svazových zpravodajů zde.