Aktualizace genomických seznamů
04.01.2019, Kamil Malát |
Před časem jsme na svazovém webu zveřejnili seznamy zvířat pěti hlavních plemen potřebných k vytvoření referenčních populací pro budoucí odhad genomických plemenných hodnot (GEPH). Vzhledem k tomu, že zájem přišel i od chovatelů dalších masných plemen, připravili jsme tyto přehledy pro všechna masná plemena, jejichž početnost umožňuje GEPH výpočet realizovat. Aktuálně je to již 14 masných plemen. Za zvýšený zájem a aktivním přístup ze strany chovatelů jsme samozřejmě velice rádi. Díky tomu již není aktuální prvotní myšlenka, že v první fázi do GEPH zapojíme jen některá plemena.
Původní úvaha totiž vycházela z předpokladu, že chovatelé nebudou dostatečně ochotni zabývat se testací starších zvířat, která mají původ již ověřen starší metodou přes mikrosatelity a veškeré náklady za SNP testaci těchto zvířat budou na bedrech svazu. To by pro ČSCHMS znamenalo neúměrně vysokou finanční zátěž, kterou bychom nebyli schopni při hromadném zapojení všech plemen najednou ustát.
Po říjnovém zasedání výboru svazu se však chovatelé plemene limousine a posléze i charolais na jednáních svých klubů jednomyslně usnesli, že část nákladů (ve výši 150 Kč/ks), které nepokryje dotace, uhradí. Toto zásadní rozhodnutí, které do celé problematiky vneslo nový impuls, bylo hlavním důvodem pro změnu přístupu ze strany ČSCHMS, kdy není již nutné ctít dohodu učiněnou výborem, která vycházela z ryze ekonomické podstaty problému. Proto, pokud se obdobně jako „limuzíňáci“ a „šaroláci“ rozhodnou i chovatelé dalších plemen, není třeba mít obavy, že se jich genomický odhad bude týkat až v nějaké další následné vlně.
Cena SNP testu pro potřeby tvorby referenční populace je identická jako v případě "klasické" testace. Pokud ale při objednávce zvolíte službu testace ČSCHMS, bude cena naúčtována nám resp. majiteli zvířete bude naším svazem přefakturováno z této částky pouze 150 Kč. Na nedávných jednání Klubů chovatelů plemene limousine a charolais bylo totiž jednomyslně chovateli odsouhlaseno, že se na celkových nákladech budou podílet právě částkou 150 Kč/ks. Zbytek nákladů bude hrazen z rozpočtu ČSCHMS resp. část jich bude kompenzována (pokryta) dotací ze strany státu. Neoficiálně se k myšlence finanční spoluúčasti ve výši 150 Kč přidali i chovatelé plemene aberdeen angus a věříme, že i u dalších plemen to bude podobné.
Abychom podpořili zdravou soutěživost mezi plemeny, je v seznamech uváděna také informace o tom, zda zvíře bylo již na čipu otestováno či nikoliv (poslední sloupec – N/A). Podle toho máte možnost zjistit, jaké plemeno je v tvorbě populace nejdále resp. které plemeno má otestováno nejvíce zvířat. Aktuálně (k 4.1.2019) je v aplikaci igenetika.cz zadáno 2.841 zvířat masných plemen skotu, z toho pro potřeby vytvoření referenční populace je to 220 jedinců. Upozorňujeme, že seznamy nejsou nijak provázány s aplikací igenetika.cz. Jejich aktualizace probíhá ručně a nejedná se tedy vždy o úplně poslední známý stav. K jakému datu je seznam platný poznáte z jeho popisku (např. stav k 3.1.2019).
Do doby, než padne i u dalších klubů (asociací) v otázce finanční spoluúčasti nějaké závazné rozhodnutí, bude stačit, pokud chovatelé projdou uvedené seznamy a od zvířat, jejichž jsou majiteli a mají je fakticky stále ve stavu, odeberou kvalitní vzorek chlupových cibulek a ten uloží do chladničky. Tím se docílí toho, že nepřijdeme o vzorky zvířat, která jsou k propojení databází nezbytná a která by chovatel v některých případech již nyní brakoval. Je třeba mít na paměti, že každé zvíře uvedené na seznamu, od něhož se nepodaří získat vzorek, budeme muset nahradit zhruba třemi či čtyřmi jinými příbuznými jedinci. Toho bychom se samozřejmě rádi vyvarovali, neboť to by celý proces nejenom prodražilo, ale i posouvalo v čase. Pokud tedy budete mít vzorky již připravené, tak jakmile bude učiněno finanční rozhodnutí jak dál, neztratíme čas a budeme schopni s nimi okamžitě pracovat a vše se významně urychlí.
V této souvislosti je třeba rovněž zmínit, že již není třeba protokoly zasílat Janu Kopeckému, neboť si je stahujeme přímo z aplikace igenetika.cz.
V případě odborných dotazů a nesrovnalostí u zvířat ze seznamů kontaktujte Alenu Svitákovou (email svitakova@cschms.cz), finanční a další dotazy směřujte na Kamila Maláta (email malat@cschms.cz).
*******************************************************************************
Další informace ke genomice a SNP na našem webu:
• Genomická testace se hezky rozjíždí: ZDE
• Genomika není jen pro vybraná plemena!: ZDE
• Charolais se připojí k hromadné testaci pro GEPH: ZDE
• Limousine se stane lídrem budoucí genomiky: ZDE
• Posílejte k testaci kvalitní vzorky, ušetříte peníze: ZDE
• Nový způsob ověřování původu v kostce: ZDE
• Revoluce v ověřování původů se blíží: ZDE
• Požadavky na genotyp SNP ze zahraničí: ZDE
• Nový set k odběru vzorků chlupových cibulek: ZDE
• Ověřování původů přes genotypizaci přichází: ZDE
Původní úvaha totiž vycházela z předpokladu, že chovatelé nebudou dostatečně ochotni zabývat se testací starších zvířat, která mají původ již ověřen starší metodou přes mikrosatelity a veškeré náklady za SNP testaci těchto zvířat budou na bedrech svazu. To by pro ČSCHMS znamenalo neúměrně vysokou finanční zátěž, kterou bychom nebyli schopni při hromadném zapojení všech plemen najednou ustát.
Po říjnovém zasedání výboru svazu se však chovatelé plemene limousine a posléze i charolais na jednáních svých klubů jednomyslně usnesli, že část nákladů (ve výši 150 Kč/ks), které nepokryje dotace, uhradí. Toto zásadní rozhodnutí, které do celé problematiky vneslo nový impuls, bylo hlavním důvodem pro změnu přístupu ze strany ČSCHMS, kdy není již nutné ctít dohodu učiněnou výborem, která vycházela z ryze ekonomické podstaty problému. Proto, pokud se obdobně jako „limuzíňáci“ a „šaroláci“ rozhodnou i chovatelé dalších plemen, není třeba mít obavy, že se jich genomický odhad bude týkat až v nějaké další následné vlně.
Seznam vybraných zvířat pro potřeby vytvoření referenční populace pro budoucí odhad GEPH najdete ZDE (xls soubor). Odkaz na soubor je k dispozici rovněž v sekci v části šlechtění a PK/genomika. |
Cena SNP testu pro potřeby tvorby referenční populace je identická jako v případě "klasické" testace. Pokud ale při objednávce zvolíte službu testace ČSCHMS, bude cena naúčtována nám resp. majiteli zvířete bude naším svazem přefakturováno z této částky pouze 150 Kč. Na nedávných jednání Klubů chovatelů plemene limousine a charolais bylo totiž jednomyslně chovateli odsouhlaseno, že se na celkových nákladech budou podílet právě částkou 150 Kč/ks. Zbytek nákladů bude hrazen z rozpočtu ČSCHMS resp. část jich bude kompenzována (pokryta) dotací ze strany státu. Neoficiálně se k myšlence finanční spoluúčasti ve výši 150 Kč přidali i chovatelé plemene aberdeen angus a věříme, že i u dalších plemen to bude podobné.
Abychom podpořili zdravou soutěživost mezi plemeny, je v seznamech uváděna také informace o tom, zda zvíře bylo již na čipu otestováno či nikoliv (poslední sloupec – N/A). Podle toho máte možnost zjistit, jaké plemeno je v tvorbě populace nejdále resp. které plemeno má otestováno nejvíce zvířat. Aktuálně (k 4.1.2019) je v aplikaci igenetika.cz zadáno 2.841 zvířat masných plemen skotu, z toho pro potřeby vytvoření referenční populace je to 220 jedinců. Upozorňujeme, že seznamy nejsou nijak provázány s aplikací igenetika.cz. Jejich aktualizace probíhá ručně a nejedná se tedy vždy o úplně poslední známý stav. K jakému datu je seznam platný poznáte z jeho popisku (např. stav k 3.1.2019).
Do doby, než padne i u dalších klubů (asociací) v otázce finanční spoluúčasti nějaké závazné rozhodnutí, bude stačit, pokud chovatelé projdou uvedené seznamy a od zvířat, jejichž jsou majiteli a mají je fakticky stále ve stavu, odeberou kvalitní vzorek chlupových cibulek a ten uloží do chladničky. Tím se docílí toho, že nepřijdeme o vzorky zvířat, která jsou k propojení databází nezbytná a která by chovatel v některých případech již nyní brakoval. Je třeba mít na paměti, že každé zvíře uvedené na seznamu, od něhož se nepodaří získat vzorek, budeme muset nahradit zhruba třemi či čtyřmi jinými příbuznými jedinci. Toho bychom se samozřejmě rádi vyvarovali, neboť to by celý proces nejenom prodražilo, ale i posouvalo v čase. Pokud tedy budete mít vzorky již připravené, tak jakmile bude učiněno finanční rozhodnutí jak dál, neztratíme čas a budeme schopni s nimi okamžitě pracovat a vše se významně urychlí.
V této souvislosti je třeba rovněž zmínit, že již není třeba protokoly zasílat Janu Kopeckému, neboť si je stahujeme přímo z aplikace igenetika.cz.
V případě odborných dotazů a nesrovnalostí u zvířat ze seznamů kontaktujte Alenu Svitákovou (email svitakova@cschms.cz), finanční a další dotazy směřujte na Kamila Maláta (email malat@cschms.cz).
*******************************************************************************
Další informace ke genomice a SNP na našem webu:
• Genomická testace se hezky rozjíždí: ZDE
• Genomika není jen pro vybraná plemena!: ZDE
• Charolais se připojí k hromadné testaci pro GEPH: ZDE
• Limousine se stane lídrem budoucí genomiky: ZDE
• Posílejte k testaci kvalitní vzorky, ušetříte peníze: ZDE
• Nový způsob ověřování původu v kostce: ZDE
• Revoluce v ověřování původů se blíží: ZDE
• Požadavky na genotyp SNP ze zahraničí: ZDE
• Nový set k odběru vzorků chlupových cibulek: ZDE
• Ověřování původů přes genotypizaci přichází: ZDE